话说那哆啦A梦穿越时空的铜锣声刚歇，蓝胖子揉着眼睛西下张望，却见霓虹闪烁的高楼大厦间，忽地窜出一道黑影！定睛一瞧，竟是戴着警帽、腰间别着警用装备的猫型警长——黑猫警长！
"呔！你这猫妖，为何在此作祟？"哆啦A梦掏出翻译魔芋，却见黑猫警长甩着尾巴，中气十足地喝道："吾乃森林警长喵！你这蓝皮机器猫，莫要妨碍公务！"
话音未落，街角突然传来"窸窸窣窣"的鼠辈脚步声。黑猫警长耳朵一抖："不好！一只耳那厮又来偷油了！"说罢拽着哆啦A梦就往仓库方向追。可那仓库外围墙太高，黑猫警长纵身跃起却扑了个空。
"看我的任意门！"哆啦A梦大手一挥，两人瞬间穿越到仓库顶棚。却见一只耳正扛着油桶往麻袋里倒，油渍顺着它仅剩的耳朵滴滴答答："哈哈哈，这次又能逍遥法外啦！"
黑猫警长掏出手枪"砰"射出一发麻醉弹，却见一只耳突然掏出一面镜子，子弹撞上镜面竟反弹回来！哆啦A梦急中生智，从口袋里掏出缩小灯对准镜子一照，瞬间将整面墙变成哈哈镜。一只耳被扭曲的影像晃得晕头转向，哆啦A梦趁机抛出黏手绳缠住它的尾巴。
"快把油还回去！"黑猫警长厉声喝道。一只耳却突然嚎叫："别得意！我还有娘舅吃猫鼠！"话音未落，仓库深处窜出三只巨型老鼠，张牙舞爪扑向二人。哆啦A梦慌忙启动时光机想带警长逃走，却因操作失误把他们送回了十年前的森林战场——
原来这里正是黑猫警长与一只耳的初次对决之地。当年白猫班长就是在这里牺牲的，黑猫警长看到残破的警徽，眼中闪过一丝悲愤。哆啦A梦赶忙用记忆面包复原现场，却见一只耳趁机挣脱束缚，化作一道黑烟逃窜。
"可恶！"黑猫警长跃上屋顶紧追不舍，哆啦A梦则召唤出空气炮在后方阻截。一人一猫配合默契，终于在立交桥下将一只耳团团围住。哆啦A梦掏出西维口袋里的"悔过书"，却被一只耳一口咬住："要我投降？除非你们把月亮给我当奶酪！"
眼看天色渐暗，黑猫警长突然指着月亮笑道："你以为这是奶酪？这是本警长用超能力制造的幻象！"说罢启动警用激光笔，一道强光射向一只耳的眼睛。哆啦A梦趁机用缩小手电筒照向它，一只耳瞬间变成米粒大小，被黑猫警长轻轻捏住塞进警车。
却说那黑猫警长与哆啦A梦将一只耳押送至森林安全局后，正欲审讯其阴谋，忽闻仓库外传来刺耳的口哨声！黑猫警长猛地起身："不好！一只耳的鼠军又来了！"话音未落，成百上千只老鼠从下水道、通风口窜出，朝着警局围攻而来。
"启动防御结界！"哆啦A梦掏出西维口袋里的"空气墙"道具，却见老鼠们突然集体后撤。黑猫警长举枪射击，子弹却撞上无形屏障被弹开——原来一只耳在鼠群中安插了食猫鼠，它正用超能力操控着鼠群！
"白鸽探长！"黑猫警长抓起对讲机，"立即启动量子探测器，锁定食猫鼠的位置！"话音未落，空中传来白鸽的鸣叫，它载着鼩鼱特工俯冲而下，利用超声波干扰鼠群行动。鼠群顿时乱作一团，食猫鼠怒吼道："该死的机械猫！看我召唤食猴鹰！"
说时迟那时快，食猴鹰的阴影笼罩了警局上空。黑猫警长拽着哆啦A梦跳上屋顶："快用任意门带我们到粮仓！"两人瞬间穿越至边境粮仓，却见一只耳正指挥食猴鹰搬运粮食："这次我要让全森林断粮！"
"看我的缩小灯！"哆啦A梦对准食猴鹰一照，巨鸟瞬间变成火柴盒大小。黑猫警长趁机抛出黏手绳缠住食猴鹰的爪子，鼩鼱特工则从通风口钻入，用麻醉针放倒看守的鼠兵。然而，一只耳的娘舅——吃猫鼠突然现身，它张开血盆大口扑向黑猫警长！
"快用记忆面包！"哆啦A梦将面包塞进吃猫鼠的嘴里，食猫鼠突然愣住，开始回忆起被黑猫警长击败的往事。趁着这空档，黑猫警长掏出手枪射出麻醉弹，吃猫鼠应声倒地。
"该死的！"一只耳见大势己去，竟吞下微型遥控器："让地下的食人花苏醒吧！"说罢钻进通风管道。黑猫警长拽着哆啦A梦紧追不舍，却在管道尽头发现了一个巨大的地下实验室——这里堆满了基因改造的怪物，墙上还贴着"征服森林计划"的蓝图！
"原来你早有预谋！"黑猫警长怒吼。一只耳狂笑："等这些怪物苏醒，你们谁也逃不掉！"话音未落，实验室突然传来警报声，原来是白鸽探长带着森林安全局全员赶到，鼩鼱特工也破解了食人花的控制中枢。
"投降吧！"黑猫警长举枪对准一只耳。谁知它突然撞向基因怪物，企图同归于尽。千钧一发之际，哆啦A梦启动时光机，将两人传送至怪物苏醒前的五分钟——此刻的实验室空无一人，只有一只耳的阴谋记录在电脑里。
"你以为这样就能阻止我？"一只耳从阴影中现身，它的身体竟融合了食猴鹰的翅膀和食人花的毒刺。黑猫警长与哆啦A梦对视一眼，同时掏出"悔过书"和"缩小灯"，在怪物苏醒的瞬间将一只耳变成米粒大小，塞进警车扬长而去。
"喵~这次算你俩走运！"被囚禁的一只耳突然开口，"等本大爷练成真正的超能力..."话音未落，警车呼啸而去，只留下一地油渍和几粒老鼠屎——这便是跨次元围剿的终章
